El Ateneo Mercantil nace el 23 de marzo de 1879 para "atender las necesidades culturales y de formación, en su profesión, de los empleados del comercio"· Sus estatutos se formalizan en 1879. Citando al II Marqués del Turia, que fue Presidente de la entidad: "En el Ateneo se ha impulsado todo, desde las Escuelas de Comercio hasta el Bolsín de Corredores, desde la Cámara de Comercio al progreso universitario, de las Escuelas de Idiomas a las Ferias de Muestras, del trasvase de aguas hasta la conservación de la monumentalidad, de la Solución Sur para la defensa de la ciudad a la obra del Puerto". Asimismo, el Ateneo hizo nacer obras tan dispares como la Sociedad Valenciana de Tranvías, la primera emisora de radio de la ciudad, la conexión ferroviaria Madrid-Cuenca, el traslado de la Iglesia de Sta. Catalina de Siena o la Asociación Valenciana de la Caridad.
De sobra conocida es también la gran empresa que el Ateneo llevó a cabo con la organización de la Exposición Regional de 1909, motor de la industria y el comercio valenciano de nuestro siglo y de la que quedan huellas tan significativas como el Himno de la Exposición, encargado por el Ateneo para la ocasión y hoy Himno Oficial de la Comunidad.
En 1960 el Excmo. Ayuntamiento de Valencia concedió al Ateneo la Medalla de Oro de la ciudad. En 1970 el Consejo de Ministros lo declaraba, Entidad de Utilidad Pública.
El Ateneo Mercantil de Valencia continúa conservando su domicilio social en la Plaza del Ayuntamiento número 18, de Valencia.
En la actualidad cuenta con alrededor de cuatro mil socios, y sigue su tendencia ascendente. Está presidido por Doña Carmen de Rosa Torner.
A lo largo de su historia, el Ateneo ha distinguido con la concesión del título de Socio de Honor a entidades y personalidades como: José Echegaray, Cirilo Amorós, Vicente Blasco Ibañez, el Diario Las Provincias, el periódico Levante EMV, Maximiliano Thous, Emilio Attard, Felix Azzati, la Exma. Diputación de Valencia, el Ayuntamiento de Valencia, Caja de Ahorros y Monte de Piedad, etc...
El Ateneo según sus estatutos se rige por la Asamblea General de Socios, que se deberá reunir reglamentariamente todos los años, en sesión ordinaria durante el primer trimestre, para aprobar las Cuentas Anuales, el Proyecto de Presupuesto y la Memoria de las Actividades de la Junta Directiva. La Asamblea General de Socios elige, libre y democráticamente, en listas abiertas, a los miembros de la Junta Directiva.
La Junta Directiva compuesta en la actualidad por 13 miembros tiene un mandato de cuatro años y renovación por mitades.